Plongé dans le coma, Dexter se réveille pour découvrir que Harrison a disparu. Déterminé à retrouver son fils et à réparer leurs liens, Dexter le suit jusqu'à New York. Très vite, il réalise que son passé le rattrape, entre le capitaine Angel Batista qui poursuit son enquête et d'anciens fantômes qui rôdent.