Akino est l'apprentie concierge d'un grand magasin vraiment spécial : les clients y sont tous des animaux. Qu'ils soient petits ou grands, à poils ou à plumes, Akino travaille dur pour satisfaire toutes leurs demandes... même les plus surprenantes.

Il s'est sacrifié pour sauver le monde et protéger ceux qu'il aimait. An 2 de l'ère Kôwa. Aujourd'hui, le monde est unifié autour de la Fédération des Nations Unies et connaît des jours de paix comme jamais auparavant, du moins en apparence... La conseillère Nunnally vi Britannia est en visite diplomatique dans un camp de réfugiés avec Suzaku Kururugi, devenu conseiller en chef des Chevaliers Noirs sous les traits de l'homme masqué Zero. C'est alors que de mystérieux Knightmare Frames attaquent le camp et kidnappent les deux représentants. Le terrible royaume de Zilkhstan serait-il à l'origine de cette crise ? Pour investiguer, les autorités dépêchent une équipe dirigée par Kallen sur les lieux. Ils feront là-bas la rencontre d'un visage familier...

La carrière de footballeur de Yoichi Isagi, un lycéen, semble s'achever prématurément lorsque son équipe perd à la dernière minute le match de qualification pour le championnat national et que sa chance d'être découvert en tant que jeune talent s'envole. Mais lorsqu'il rentre chez lui après le match, une lettre l'attend : l'Association japonaise de football l'invite à un camp d'entraînement spécial ! Il devient rapidement évident que ce camp est en effet inhabituel, car tous les joueurs invités semblent être des attaquants. Un homme se présentant comme Jinpachi Ego apparaît sur scène et explique qu'il s'agit du projet BLUE LOCK, dont l'objectif est de créer au Japon un attaquant capable de se mesurer aux meilleurs du monde. Seul un participant sur 300 pourra s'imposer - celui qui sera éliminé sera exclu à vie du football professionnel...

Dans un monde divisé entre l'intérieur et l'extérieur, ceux qui vivent dans les deux royaumes ont pour consigne de ne jamais passer de l'autre côté, sous peine d'être maudits. Une jeune fille nommée Shiva vit de l'autre côté, dans un village abandonné, avec un gardien démoniaque connu uniquement sous le nom de Professeur. Bien qu'il leur soit interdit de se toucher, elles semblent partager un lien qui transcende leurs apparences disparates. Mais lorsque Shiva quitte la garde du Professeur pour partir à la recherche de sa grand-mère, le secret de son mystérieux mode de vie apparaît au grand jour...