Le Dr Shaun Murphy, un jeune chirurgien atteint d'autisme continue de travailler sans relâche pour prouver à ses collègues que ses dons médicaux extraordinaires permettent de sauver des vies. Tout en préparant le mariage de Lea et Shaun, la saison 5 voit le jeune médecin faire face à de nouvelles incertitudes alors qu'un changement majeur intervient à St. Bonaventure. Quant au reste de l'équipe, elle doit également faire face aux changements... tout en continuant à faire face à des situations de vie ou de mort. Good Doctor, Dr Murphy fait toute la différence !

Lily Bloom surmonte une enfance traumatisante pour se lancer dans une nouvelle vie à Boston et poursuivre son rêve de toujours d'ouvrir sa propre boutique. De sa rencontre fortuite avec le charmant neurochirurgien Ryle Kincaid nait une connexion intense - mais alors que les deux tombent profondément amoureux, Lily commence à entrevoir des aspects de Ryle qui lui rappellent la relation de ses parents. Lorsqu'Atlas Corrigan, le premier amour de Lily, réapparait soudainement dans sa vie, sa relation avec Ryle est bouleversée et Lily réalise qu'elle doit apprendre à s'appuyer sur sa propre force et faire un choix impossible pour son avenir.